.cram Bestandsextensie
Bestandstype Compressed Alignment File
| Ontwikkelaar | EBI |
| Categorie | Gegevensbestanden |
| Formaat | Binary |
.CRAM optienummer
gecomprimeerd uitlijningsbestandsformaat ontwikkeld door EBI, een buitenstation van het European Molecular Biology Laboratory; slaat korte leessequenties voor DNA-sequenties op die zijn gegenereerd uit korte leesrichtlijnen zoals BWA, BBMap en BLAT.
De CRAM-bestandsindeling is vergelijkbaar met de Binary Alignment / Map (BAM) -bestandsindeling, maar biedt betere bestandscompressie en een geherstructureerde kolomgeoriënteerde binaire containerindeling. Naarmate de gegevensvolumes toenemen in het gebied van genetische software, werd het CRAM-formaat ontworpen om de schijfvoetafdruk van uitlijningsgegevens te verminderen.
Korte leesuitlijning is het proces van ontcijferen waar een reeks vandaan komt in het genoom. Dit kan moeilijk zijn, omdat het referentiegenoom nogal groot is en u niet altijd op zoek bent naar exacte overeenkomsten in het referentiegenoom. Korte leesrichtlijnen worden gebruikt om enorme reeksen te zoeken naar overeenkomsten en bijna-overeenkomsten. Omdat de reeksen zo groot zijn, is compressie geboden door indelingen zoals CRAM noodzakelijk om bestandsgroottes beheersbaar te houden.
| Windows |
|