MOHO-bestand geopend in Smith Micro Moho Pro 12
Omdat MOHO-bestanden animatieprojecten opslaan, zijn dit de meest bekende bestanden bij Moho gebruikers. U kunt een MOHO-bestand maken door Bestand → Nieuw of Nieuw uit sjabloon te selecteren en het vervolgens op te slaan door Bestand → Opslaan of Opslaan als te selecteren. Om een MOHO-bestand te openen, selecteert u Bestand → Openen ... of Recent openen ... en selecteer het MOHO-bestand.
MOHO-bestanden zijn oorspronkelijk gemaakt door vroege versies van Moho. Het bestand werd echter vervangen door het bestand .ANME toen Moho Anime Studio werd. Uiteindelijk werd Anime Studio in versie 12 hernoemd als Moho, die het MOHO-bestand gebruikt om projecten op te slaan. Huidige versies van Moho ondersteunen nog steeds ANME-bestanden.